Gubernur DKI Jakarta, Pramono Anung, mengungkapkan bahwa masih ada pihak yang tidak setuju dengan pelaksanaan Operasi Modifikasi Cuaca (OMC) sebagai bagian dari upaya penanganan banjir di ibu kota. Bahkan, ada kesan bahwa sebagian pihak justru merasa senang ketika Jakarta dilanda banjir. Meskipun OMC merupakan langkah mitigasi yang dilakukan Pemerintah Provinsi DKI Jakarta untuk mengurangi intensitas hujan ekstrem dan potensi banjir, kebijakan ini mendapat kritik dari beberapa pihak, termasuk Anggota DPRD DKI Jakarta Fraksi PAN, Lukmanul Hakim. Menurutnya, kebijakan tersebut dianggap tidak tepat sasaran dan hanya menghambur-hamburkan uang.
Center for Budget Analysis (CBA) juga ikut memberikan kritik terhadap pelaksanaan OMC. Direktur Eksekutif CBA, Uchok Sky Khadafi, menyoroti pola pelaksanaan OMC yang dinilai bermasalah, terutama terkait peran Badan Penanggulangan Bencana Daerah (BPBD) dan Badan Meteorologi, Klimatologi, dan Geofisika (BMKG). Ia mengungkapkan kekecewaannya terhadap BPBD dan BMKG karena melihat bahwa setiap penanganan banjir dengan OMC selalu dimonopoli oleh BMKG.
Di sisi lain, efektivitas OMC juga dipertanyakan setelah beberapa wilayah Jakarta masih mengalami banjir meskipun operasi modifikasi cuaca telah dilakukan. Banjir yang disebabkan oleh meluapnya debit air Kali Ciliwung akibat hujan deras memperkuat perdebatan publik terkait efektivitas, transparansi anggaran, dan kebutuhan evaluasi menyeluruh terhadap kebijakan penanganan banjir melalui OMC di Jakarta.
